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CRISPR系统新发现!也可将RNA片段整合进宿主基因组

2018-10-05 阅读(158)

 CRISPR(clustered regularly-interspaced short palindromic repeats,成簇的规律间隔性短回文重复序列)系统调控着许多种原核生物体内的适应性免疫应答。CRISPR本身其实就是细菌基因组DNA上的一段特 殊的序列,这段序列倒是很有个性:几十个碱基构成的特殊DNA序列连续串联重复多次,在重复单元之间的间隔也差不多有几十个碱基那么长,但是这些间隔序列 的构成却是千变万化毫无规律可循。


在一项新的研究中,来自美国德州大学奥斯汀分校和斯坦福大学医学院等机构的研究人员在被称作 地中海海单 胞菌(Marinomonas mediterranea, MMB-1)的海洋细菌中,发现该细菌利用一种新鉴定出的涉及核糖核酸(RNA)的机制识别和破坏危险的病毒:利用RT-Cas1融合蛋白以一种RT依赖 的方式捕获病原体的RNA片段,然后MMB-1 RT-Cas1Cas2将这些RNA片段整合到该细菌基因组的CRISPR序列中,然后逆转录这些RNA片段,将它们变成位于CRISPR重复序列之间 的cDNA。这种识别和破坏病毒的系统类似于捕获外源DNACRISPR/Cas9系统。这一发现可能导致人们开发出更好的方法阻止杀死农作物的病毒和 干扰诸如奶酪和酸奶之类的乳制品制造的病毒。

 

相关研究结果发表在2016226日那期Science期刊上,论文标题为“Direct CRISPR spacer acquisition from RNA by a natural reverse transcriptaseCas1 fusion protein”。